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環境設定フォルダーの再作成を試してみてはどうでしょう。

After Effects再起動時に以前の環境を「移行しない」を選択して下さい。

おかしいなと思ったら（Windows 版 After Effects CC） 

おかしいなと思ったら（Mac OS 版 After Effects CC） 

改善しない場合は、再インストールも試して下さい。
再インストールは、アンインストール後にプログラムフォルダーに残っているv25のフォルダーを別の場所に移動させてからクリーンな状態でインストールをして下さい。