AfterEffectsのプロジェクトが保存できなくなる

同様の症状が出て解決しました。

プロジェクトを開き、オフラインファイルを再リンクすると保存できない症状になりました。

（何度保存しても、一番上のバーにあるプロジェクト名のあとに「＊」がついたまま）

別名保存、別ドライブに保存など全く出来ません。

自分の解決した方法は、「再リンクするファイルの順番を変えてリトライする」でした。

一つのファイルを再リンクすると、同一フォルダ、同一階層のものも自動で再リンクしてくれますが、

その「自動」というところが悪さをしている可能性があるような気がします。

（ファイル名も半角英数でした）

逆に再リンク後に大掛かりな作業をして、この症状が出てしまうと詰んでしまう可能性もあります。

（バージョンCC2025）

AEのトラブルの場合は下記を試すと改善する傾向が多いのですが、

■おかしいなと思ったら（Windows 版 After Effects CC）
下記ヘルプの「B. 環境設定フォルダーの再作成」が該当します。
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/kb/cq02250243.html

■おかしいなと思ったら（Mac OS 版 After Effects CC）
下記ヘルプの「B. 環境設定フォルダーの再作成」が該当します。
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/kb/cq02250244.html

それでも改善しない場合、
下位VerのAEを使用する、新規プロジェクトでも同じ現象が発生するかなど細かな問題の切り分けを行っていく必要がでてきます。

指定しているキャッシュディスクを含め、空き容量が十分にありますか。