AppleのMotionで作成したファイル(.motn)をAFで開くことはできますか？

一部訂正させていただきます。

再度、Automatic Duckのサイトを調べたところ、After Effectsに読み込むプラグインXimport AEは開発元のRed Giantが開発を終了したため販売も終了していました。

また、Ximport AEはFinal Cut Pro専用でMotionファイルの読み込みには対応していませんでした。

申し訳ありませんでした。

Windowsで読み込む方法がわかりました。

After Effects　＜ファイル＞ → ＜読み込み＞ → ＜Pro Import Aftter Effects…＞

上記のメニューから、Motion・Final Cut Pro等のファイルを読み込めます。

古いバージョンだと、「Automatic Duck」という別売りのプラグインが必要だったのが、CS6からアドビが買収して標準機能になっています。

Windows版のCC2017はインストールしていないので確認していませんが、CC2015には搭載されています。

CC2017をお持ちなら、確認してください。

補足になりますが、

Motionを所有していないので、動作確認はできていませんが、下記の質問の回答によるとQuickTImeムービーに変更されるようです。

motionのプロジェクトをAfterEffectsで開くには |公式 Apple サポートコミュニティ