クリップスタジオからコピーして貼り付けたデータの編集

それだとビットマップとしての配置になっていませんか。

そうなるとIllustratorではカラーの調整はできません。

クリスタからですとpsdで書き出してからPhotoshopで調整が無難ですが、いずれにしてもベクターではないので、ベクター要求の場合はIllustrator自体で作り直しすることになると思います。

（求められた先との話し合いもした方がよさそうには思います）

どのような処理でデータを作りましたか?

ベクター書き出しでSVGを書き出したのならIllustratorで開いてドキュメントのカラー設定をCMYKに変更した上で各パスの塗りと線の設定を調整すれば良いのではないかと思います。

ドキュメントがどの様な状態なのかが分からないとこれ以上の事は判断できません。