バウンディングボックスの表示される位置が、実際のオブジェクトの位置とズレる

ちなみに、この挙動は必ず起きていますか？

特定のオブジェクト・ドキュメントだけであれば、新規に作り直した方が早いかもしれません…

常にズレが発生する場合は、他に、

　アウトライン表示ではどうか？

　オーバープリントプレビューをONにするとどうか？

　ピクセルプレビューをONにするとどうか？

　一旦、バウンディングボックスを隠す→再度表示する

といった、表示関係の設定を変更してみても治りませんか？

また、差し支えなければ問題のファイルをアップしていただき、確認させていただくことも必要かもしれません。

　他のPCでも発生するのであれば、ドキュメントの問題

　他のPCで発生しなければ、アプリケーションの問題

だと推測できます。