リンク名が消えます、、、

以前UserVoiceにも同様の投稿があったのですが，Adobeスタッフさんもクラッシュによるファイル情報の欠落だろうとの見解でした。

Ten Aさんが懸念されているように，復元されたデータを継続して編集すると（リンク情報そのものが消失してしまうなど）別の影響が出る可能性もありそうです。

Windows – Adobe Illustrator 

大変ですねぇ…。いったんそうなってしまうと解決方法はないはずです。

復元機能はそもそも「復元できればラッキー」くらいの機能で、それに頼るのは避けるべきでしょうね。

こまめに保存操作を繰り返すのが唯一の解決方法でしょう。画像が多いと保存時間が長くなりストレスフルなので、保存時の「PDF互換ファイルを作成」をあえてOFFにして保存時間を節約するのもありだと思います。

確かにリンク情報が欠落しやすくなっているようには思いますが、これはクラッシュの結果ですから元より完全に再現さていない可能性がある事を肝に命じてください。クラッシュの影響はどこまで残るか想定できません。出来れば直近の保存状態までロールバックした方が無難ではあります。
度々クラッシュを繰り返すようであればストレージの状態のチェックやメモリの増強等の対策を行うべきなのかもしれませんし、データ構造に関しても負荷の強弱はありますので、データの作成手順で対応できる部分もあります。