外付けHDへのバックアップ時の画像のリンク切れ

user6709844 さん

そこは見逃していました！ 実際に確認したので整理してみると、

1. 保存時のフルパスにリンクファイルが存在すれば、そのファイルとリンクする。
2. そのフルパスにリンクファイルが存在しなければ、同階層の同名ファイルとリンクする。
3. 同階層に同名ファイルがなければ、Linksフォルダ内の同名ファイルとリンクする。
4. CC 2018 NEW：Linksフォルダ内に同名ファイルがなければ、同階層内のフォルダの最下層まで探して同名ファイルとリンクする。

CC 2018で、4 番目に探しに行く場所が追加されていました。

ここで注意しないといけないのは、保存時のフルパスのフォルダ構成はまったく考慮されず、とにかく上記の順番で探しに行くことです。極端な例ですが、下図のように同じ名称の異なるファイルを一緒にリンクしていた場合、1 で見つからなければ 2 で見つけたファイルにすべてリンクされるので、同階層のファイルのみにリンクが差し替わってしまいます（この注意点は従来と同じ）。

改善であるのは確かです。一方で、4 番目の条件が加わったことで、知らないと何がどうなっているのかますます混乱したり誤解したりするでしょうね。

Illustratorファイルの同階層にLinksフォルダがあっても、かならず自動的にその中とリンクされるわけではありません。このあたり混乱しやすいので要注意。

リンク画像ファイルが、似た名称のファイルに勝手に差し変わることはありえますか？

「どのファイルとリンクしているのか」の情報はフルパス（絶対パス）で保存されています。これが大前提。そしてIllustratorファイルを開いたときに、イラレさんは次の順番でリンクファイルを探しにいきます。

1. そのフルパスにファイルが存在すれば、そことリンクする。
2. そのフルパスにファイルが存在しなければ、同階層の同名ファイルとリンクする。
3. 同階層に同名ファイルがなければ、Linksフォルダ内の同名ファイルとリンクする。

要は、Linksフォルダは3番目に探しにいく場所ってことです。

最も確実なのは、Yamo74さんの回答「パッケージ機能を使って直接バックアップ先にパッケージ」でしょうね。