Script からのオブジェクト選択

まず、スクリプトからはマウスポインタの位置情報は取れませんので通常のツールのような動作を想定しているのであれば不可能です。それはプラグインを作成すべきものです。ajabonさんの指摘のような座標指定の場合は出来ます。ただし、Illustratorで矩形範囲に図形が引っかかるかどうかをチェックするのってすんげ〜面倒です。ベジェ曲線の特定区間がエリアにかかるかどうかを順繰りにアンカーポイント情報を拾いながらすべて演算する必要があるからなんですけど、そうれはもう、血を吐きそうなぐらい数学のお勉強も必要になってくるものです。
まあ、パスファインダー前後で面積を比較するって抜け道があるんですけどね……

指定範囲は、座標領域ということですね。

全オブジェクトをループして座標値を取得、任意の領域内なら選択、ちがえば非選択

という地道めな処理になります。