Media Encoder で書き出した圧縮音源(MP3, AAC)にノイズが乗る

お世話になります。

After Effects で動画編集 → Media Encoder で書き出しをすると音声に定期的にクリップノイズ（プツプツ）が乗ってしまいます。音声は Cubase で編集・書き出し(48kHz/24bit WAV) をしたもので、この時点で音声にピークほか異常は全くなく、それを読み込んだAE上でのプレイバックの時点でも全く異常なく再生されます。AEのオーディオメーターでも赤はでません。

問題を切り分けるべく色々試したところ、
・MEで圧縮 MP3, AAC だとビットレートやモノ/ステレオ等変えてもノイズ乗る
・MEで非圧縮 WAV だとノイズが乗らない。
・AEでレンダリングすると音声形式の圧縮・非圧縮問わず正常に書き出しできる
ということが分かり、MEのしかも圧縮に関わる部分が怪しい？？というところまでは行き着いたもののその後の打つ手が分かりません。

日頃同じ設定で動画制作・書出しをしていてこの様な異常がおきたことがないのですが、普段との違いがあるとしたら、強いて言えば音声の 1kHz~2kHz帯域がすこし強め…ですが、音量も抑えて試していてピーク由来とは考えづらいです。

OS WIN 10
AE, ME CC 2021
Cubase Pro 10
※すべてアップデート最新

ME 書き出し設定
H264/MP4 デフォルトの「高速ビットレート」
ほか音声のみ MP3, AAC, WAV を検証（ステレオ・モノ両方検証

Cubase書き出し設定
48kHz 24bit WAV（ステレオ・モノ両方検証

ほか必要な情報はすぐ追記いたします、ご助言の程何卒よろしくお願いいたします。