カメラ素材（29.97f）とGoPro（30.00f）を積む際のいい方法

29.97fpsと30.00fpsの混在がズレの原因ではない可能性もあるように思います（30.00fpsの素材を、動き優先のためにフッテージを変換で29.97fpsにした場合には、遅れるようになります）。

30.00fpsの素材がどのくらい遅れている・進んでいるかということを計算して、メインのカメラを基準にしてGoPro側のフレームレートを「フッテージを変換」で変えるとうまくゆくかもしれません。

（私自身では実際の素材で検証していないので、完璧にうまくゆくかはわかりません。しかし少なくとも、手動でフレームを詰めるよりは効率的だと思われます。）