カラーキーを適用するとプレビューできなくなる

お使いの環境に依るので一概には言えないのですが、カラーキーにて問題が起きている素材と問題が起きていない素材のフレームサイズが異なるなどの要因と、GPUの処理能力が関係しているようにも思えます。

解決策ではないのですが、問題の切り分けのためプロジェクト設定のレンダラーをソフトウェア処理にして試してみたり、環境設定のメディアでハードウェアデコードをOFFにしてみるなどの対応が考えられるかと思います。

また、お使いのパソコンのGPUのドライバも検証する必要があるかもしれません。