クリップの音声が違う

画像を拝見しますと、.m2tsという拡張子なので、Premiere Pro以外の何かしらアプリケーションで取り込んだAVCHD素材ではないかと推測しております。

AC3（ドルビーデジタル）の音声はオーディオキャッシュが作成されるので、お書きいただいている通りこの手のトラブルの際には「メディアキャッシュの削除」で直ることが多いのですが、今回はそうではないようですね。

>バージョン24辺りで編集していたものになるのですが、

とのことですので、一旦バージョン24.xにダウングレードしていただき、そのうえでメディアキャッシュをすべて削除してからお試しいただくとかがでしょうか。

v25.xとv24.xは共存できますため、プロジェクトファイルをダブルクリックする開き方では意図せずv25.xが開かれる可能性もありますため、v24.xを立ち上げたうえで該当のプロジェクトファイル（v25.xで上書き保存していない、v24.xで保存していたもの）を開いてみてください。