トランジションをかけてもクリップの切れ目でバツッと切り替わるのが見える

>結局この部分が何故そうなるか自分の知識では理由付けは叶わなかったのですが、考え込んでも仕方がないので、

仰る通り、時間を無駄にするよりは代案で乗り切る方が効率的ですね。

今回の現象の原因はわかりませんが、エフェクトで「パカッと見え方が変わる」という症状は、リニアカラー処理の関係で発生することがあります。よく聞かれるのが、輝きやボケエッジを付けた素材のボケ部分の透明度が、エフェクトを使用すると「パカっ」と変わるという症状です。

他に、もネストの中の処理やシーケンスの設定の組み合わせなどによって予期せぬ結果が出るかもしれませんので、なんとなくでも「こういう組み合わせだとダメっぽい」というようなことを、ノウハウとして貯めてゆかれるとよいのではないかと思います。

添付画像を拝見しますと、クロスディゾルブの部分に斜線が入っていますね。おそらく、クロスディゾルブを適用した時に予備フレームが不足しているという警告が出たと思います。

（元素材の動画の長さに余裕があっても、ネストした状態ではネストした時点の尺となります。）

前半が動画、後半は静止画とのことですので、前半で動いていた動画がクロスディゾルブの中点で静止して、引き続きディゾルブの効果がかかっている状況かと思います。

お書きいただいている症状とは異なるのですが、クロスディゾルブの中点で動画が静止することで切れ目が目立つように見えている可能性もあるかもしれません。

お早うございます、negitamaさん

＞これと別のところで写真→動画で全く同じようにクロスディゾルブをかけているところは、全く問題なくトランジションが適用されていて、・・・

個人的には、トランジションは一般的なクリップよりシーケンスクリップのほうがPCへの負荷が高くなるような気がするのですが。PCの性能によっては、その症状を呈する原因の可能性があるかも知れません。

いろいろ試してみてください。

①レンダラーが「Mercury Playback Engine - GPU高速処理(CUDA)」に設定されていたら「Mercury Playback Engine - ソフトウェア処理」に設定変更します。

レンダラーの設定は、メニューの「ファイル」→「プロジェクト設定」→「一般」を選択し、開いた「プロジェクト設定」ウィンドウの「レンダラー」項で出来ます。

②トランジションの部分にレンダリングをかけてみます。

トランジションをかけた部分のレンダリングバーが赤色になっている場合は、トランジション部にワークエリアを設定して「Enter」を押します。黄色かグレーの場合はワークエリアを設定後、メニューの「シーケンス」→「ワークエリアでエフェクトをレンダリング」を選択します。

＞ちなみに、左のクリップは動画で終わり、右は写真から始まってるのですが、それは関係あるのでしょうか？

関係ないと思います。

＞ネスト化してクリップ同士のトランジションは出来ないのでしょうか。

シーケンスクリップどうしでも適用できますよ。