私も時々「プロジェクトマネージャー」が原因不明のエラーを吐くことがあるので(本当に原因がわからないこともあれば、特定の素材が原因だとわかったこともあります)、少しクセのある機能だとは思っていたのですが、今回ご投稿いただいたようなエラーの発生は未経験でした。
あいにく私が調べた範囲では有益な情報が得られなかったのですが、なかなか返信がつかないようなので私なりに返信してみます。
まず、この症状は全てのプロジェクトで発生していますでしょうか。
もし特定のプロジェクトのみで発生する場合には、そのプロジェクト(収集対象のシーケンス)で使用している素材がきっかけになっている可能性や、そのプロジェクト自体に軽微な破損があるといったことが考えられるかと思います。
例えば、新しいプロジェクトを作成し、元のプロジェクトの収集したいシーケンスをコピーして新しいプロジェクトにペーストし、その新しいプロジェクトの方でプロジェクトマネージャーを実行していただくと変化はございませんでしょうか。
その他には、プロジェクトマネージャーの設定を変更してみる(クリップ名に合わせてファイル名の変更にチェックが入っていましたら、それを外してみるなど)ことで、改善が見られる可能性もあるかもしれません。
もし、あらゆるプロジェクトファイルで同じエラーが発生する場合には、環境設定のリセットなど、Premiere Proで問題が生じた際の一般的な対処法をお試しいただくことで、変化があるかもしれません。
【トラブルシューティング】Premiere Proの環境設定初期化方法 - Adobe Community - 14087098
ちなみに、急場凌ぎの回避策としては、環境によっては操作が難しく、あまりお勧めできる方法ではないのですが、『「メディアマネージャーで収集した素材」と「元のプロジェクトファイルをコピーしたもの」を組み合わせ、プロジェクトを開いてオフラインになるファイルのみ手動でコピー』という方法を行ったことが過去にございます。
この方法を行うためには、元のプロジェクトファイルと素材一式が「外付けドライブ」や「NAS」にあるなど、収集後のファイルを検証する際にアンマウントできる環境(もしくはもう一台のパソコンで検証できる環境)である必要がございます(そうしないと、元のファイルにリンクされてしまいます)。