保存していたテキストが勝手に変更されました

>ちなみに表示が出ないようにするにはどうしたらよろしいでしょうか？

「表示が出ないようにする」という部分の意味合いによりますが、表示を出さずに自動的に元々使用していたフォントにリンクさせるためには、モリサワと契約するなどして使用しているフォントをインストールする必要があります。

そういう意味ではなく、他のフォントに自動的に置き換わっても良いから表示をさせたくない、ということですと、パッと調べた限りではそのような設定は見つけられませんでした。

使用していたフォントが見つからないことは、編集作業的にはかなり重大な警告なので、表示させないという選択肢は無いのではないかと思います（欠落しているフォントの置換候補を設定する部分は環境設定のグラフィックの項目にあります）。

フォントが勝手に変わってしまうと、フォント自体のデザインはもちろん、レイアウトのずれなどが生じて映像作品として問題になることも多いと思いますので、「表示させない」ことによるメリット（ボタンのクリックが面倒などでしょうか？）よりもデメリットの方が大きいと思います。

警告表示を見ながら、その作品に適切な代替フォントを選ばざるを得ないかと思います。