解決済みになっているのですでに解決なさっているのではないかなと思っていたのですが、一応返信してみます。
>作業中にホームから新規プロジェクトを開けると プロジェクトファイルの新規タブの中に表示されます
>タイムラインは作業中のままの素材が入っています
こちらは、新規プロジェクトに作業中の素材・タイムラインが入っているのではなく、それまで作業なさっていたプロジェクトの方のシーケンスが開いたままになっているという点に注意が必要かと思います。
新規プロジェクトの方をプロジェクトパネルでご確認いただくと、シーケンスも素材も読み込まれていない、まっさらな状態で開いていると思います。
Premiere Proは複数のプロジェクトファイルを同時に開くことができますので、「それまで作業していたプロジェクト」と「新たに開いた(作成した)プロジェクト」の、2つのプロジェクトが開かれている状況というわけです。
お書きになられている通り、作業中のプロジェクトを保存して閉じてから、新規プロジェクトを作成していただく方が、わかりやすいと思います。
余談になりますが、今回のようなケースで、これまで作業中だった素材が新しいプロジェクトに「自動的に複製」されていると勘違いして消してしまい、そこに新たな素材を読み込んで編集を進めてしまうというトラブルを過去に見聞きしたことがございます。
新しいプロジェクトで作業しているつもりが、実際にはその前に作業していたシーケンスの中身を消してそちらで編集していたわけです。
これが、冒頭の方で「注意が必要」と書いた理由でございます。