横と縦

こういったケースでは「用途次第」なので、「どちらが正解」とは言えないかと思います。

たとえば、横長のテレビでの視聴でしたら横長に合わせることになりますし、SNSなどスマホで縦長視聴を目的とする場合には縦長に合わせるのが自然、ということになるかと思います。

変換の方法も、状況次第になると思います。

まずは「最終的な用途」に合わせて横長か縦長のシーケンスを作成し、「フレームサイズに合わせてスケール（ご参考URL 「フレームサイズに合わせてスケール」で複数のクリップを組み合わせる方法 ）」という機能を使いながら編集し、必要に応じて「エフェクトコントロール」の「モーション」にある「位置」と「スケール」で適宜トリミングするといった方法が考えられるかと思います。

横長と縦長の両方のバージョンで仕上げるといった場合には、「オートリフレームエフェクト」も役立つかもしれません。

ソーシャルメディア用にメディアチャネルを自動的にリフレーム