１フレームがズレる現象が発生しました…解決法はあるのでしょうか？

VFR素材の扱いはなかなか奥深いので、本気で考えると状況により細かく対応を変える必要がありますので、なかなか簡潔には書きにくいものです。今回は、VFR-CFR間の変換（Premiere Pro内部で行われるものも含みます）でのフレームの重複・欠落を許容しつつ難しくない考え方で書いてみます。

なお、可変フレームレート素材のフレームの扱いについては、下記リンク先の「可変フレームレートファイルのサポート」もご参照いただければと思います。

サポートされているファイル形式 (https://helpx.adobe.com/) 

iPhoneのVFR素材を編集する際に、事前にHandBrakeなどでVFRからCFRへの変換が必須か否かという件に関しては、元素材をそのまま使用して「音ずれ」や「映像の乱れ」などの不具合が無ければ、変換は不要だと思います。

※ただし、プロキシを使った編集をする場合はCFRへの変換が必要です。

パソコン画面録画（ウェブ会議など）のVFR素材など、問題が起きやすいタイプの素材もあるので、そういった素材を扱う場合にはすべてCFRに変換してから作業に入った方が良いと思います。

iPhoneで収録される映像は、整数のフレームレートがベースになっていると思いますので、YouTube公開前提の作品でしたら、シーケンスのタイムベースはプリセットの中から素材のフレームレートに近い整数のもの（今回のケースでは30.00）にしていただくのが無難かと思います。

前回の返信と重複しますが、1/1.001のフレームレートである必要があるテレビ視聴向け（放送のほかDVD・Blu-rayなど）の場合は、タイムベースは29.97に設定します。そのうえで、フッテージの変換でフレームレートをシーケンスのタイムベースと同じ数字に書き換えることで、フレームの欠落・重複を防ぎます（ごくわずかに速度が変わるので、音声のピッチが極めて重要な作品では行わない方が良いです。）。

タイムベースが29.99や30.11など微妙な値になってしまっている既存のシーケンスは、シーケンス設定で30.00に変更することも可能ですが、シーケンス上の各編集点にて微妙なズレが発生する可能性があります。ですので、既に完成している作品で書き出したファイルにも何ら問題が無いという場合には、手間をかけてまでタイムベースを修正しなくても良いのではないかと、個人的には思います。

もしタイムベースを変更なさる場合には、変更後にすべての編集点で問題が起きていないかご確認いただいた方が良いと思います。

（万が一にそなえて、元のプロジェクトを「別名保存」して作業なさることをお勧めします。）