６つの画像を「均等の大きさで配置させる方法」が知りたい

サイズ調整は個別に行う必要があるとして配置に関してですが、

PrではなくAeだとAiやパワポなどでよく見かける配置に関するツールが標準でございます。

https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/how-to/position-transform-layers.html

Prから該当クリップを右クリックの後「AfterEffectsコンポジションに置き換え」でAeに持っていく事が可能ですー

「効率的」かどうかはわかりませんが、こういった操作をマウス操作で手探りで行うのはおそらく「非効率的」だと思いますので、数値を計算して作業していただいた方が結果的には早く効率的にできる可能性があると思います。

シーケンス設定が1920×1080で２行３列の場合、1つの画像は1920/3と1080/2で、640×540ですね。それぞれの画面で使用している画像のサイズが一定でトリミングしない場合はそのまま縮小でもよいと思いますが、640×540のシーケンスを6個作成してネストする（6分割画面のうち一つがフル画面に拡大するといった動きがあれば1920×1620のシーケンスで作成するなど、状況に合わせて変更します。）

それぞれの配置の位置も同様に、マウス操作ではなく数値で入力していただいた方が確実に均等に配置できると思います。