h264のmp4は出せるのに、h264のmovが出せない？

下記リンク先にあるタイミングでH.264コーデックのMOVファイルが書き出しできなくなったと記憶しております。

QuickTime 7 時代の形式およびコーデックのサポートの中止

H.264自体は上記リンク先で書かれている「古いコーデック」には当てはまらないと思うのですが、Windows版のQuickTimeのサポートは数年前に終了していますので、一部のプロ向けコーデック以外のmov書き出しがサポートされなくなるのも時代の流れなのかなぁと、個人的には思っています。

H.264コーデックのMOVも、タイムコードがらみや音声トラックの自由度もあってプロの間で使われていたと思いますが、mp4で代用できるという判断なのではないかと思います。

Mac版でしたら、CC2017をインストールすることで今でもH.264コーデックのMOVコンテナファイルを書き出せると思います。