insta360x2で撮影したVR動画のプレビュー表示、ならびに書き出しずれについて

プレビューの時点でおかしいようですので書き出しもうまくゆかないと思いますので、まずはプレビューできちんとみられるようにする必要があると思います。

Insta360のアプリをインストールするとPremiere Pro用のプラグインがインストールされて「.insv」ファイルを直接Premiere Proで読み込めるようになりますが、プロジェクトパネルにて「.insv」ファイルを右クリックして「クリップに最適な新規シーケンス」を選んでいただくと、適切な設定のシーケンスができると思います。

一度、この方法で作成したシーケンスにて、VR表示をお試しいただくといかがでしょうか。