macbook pro ハードウェアアクセラレーションはサポートされていません と表示されてしまいます

マシンパワーによっても時間のバランスが異なるので（CPUとGPUの能力に依存するので）、時間短縮最優先でしたら、実機で最適な設定を検証するのが一番ですね。

釈迦に説法になってしまうかもしれませんが、素材の仕様とシーケンスの仕様と書き出しの仕様にてフレームサイズの不一致などがありますと、品質の低下や処理時間の増加にもつながりますので、注意が必要かと思います。

ちなみに、古い2013年モデルのMacBook Proでの検証なのですが、素材・シーケンス・書き出しの設定を合わせてエフェクトなど使用しない状態で、「ソースの一致・高速ビットレート」と「ソースの一致・中速ビットレート」のエンコード時間を比較すると、「ハードウェアエンコーディング」ではほぼ同じ、「ソフトウェアエンコーディング」では2割程度後者が速いという結果でした。