お早うございます
提示頂いた情報を整理すると、下記のようなことでしょうか(私の解釈)。
・.movファイルは正常に読み込める。.mp4ファイルは今まで読み込めていたファイルも「プロジェクト」パネルに読み込めない。.mtsファイルも同様。
・.mp4ファイルをエクスプローラー上でダブルクリックすれば、正常に再生できる。
・最近インストールしたソフトをアンインストールしたが解決せず。
・最近Premiere Proをv14.3にアップデートした。
上記からPremiere Proの問題のような気がします。下記①~③を試してみてください。
①「おかしいなと思ったら」文書(下記リンク)の「B. 環境設定フォルダーの再作成」項を行います。
https://helpx.adobe.com/jp/premiere-pro/kb/cq02250242.html
②上記①で改善しない場合、v14.3をアンインストールした後、v14.3を再インストールします。
アンインストールする際は、最初に「Creative Cloud Desktop」ウィンドウの「Premiere Pro v13.4」の「開く」の右側にある「横3点」アイコンをクリックして開いたメニューから「アンインストール」をクリックします。
下図ウィンドウが表示されたら、「削除」を選択し、進めてください。

③上記②で改善しない場合、v14.3をアンインストールした後、v14.2にダウンデートします。