Photoshopで作成したテロップをPremiereに読み込むと、レイヤー効果の見た目が違うのはなぜ？

「リニアカラーで合成」のチェックについては、入れる・入れないのどちらが正しいというものではなく、状況に合わせてご選択いただくしかないかと思います。

Photoshopやそのほかのソフトでの表示結果と合わせるために、そしてレイヤーを分けてディゾルブを使用したときの急峻な変化を避けるために、チェックを外す運用をされている方も多いと思います（私もたいていはずしています）。

しかしながら、このチェックを外していても、GPUレンダリングが有効の場合、もしくはソフトウェアレンダラーでも「最高レンダリング品質」にチェックを入れている場合は、一部のエフェクトがリニアカラーで処理されるようです。

例えば、テロップにトランジションのワイプを使用する際、ワイプのかかり始めからシャドウの濃さが変わるといった問題が起きる場合があります。

自然界の理屈に合わせるならば、ガンマ補正がかかった状態（非線形）での合成ではなく、リニアカラーで合成した方が自然な結果にはなるのですが、なかなか、難しいところです。