Shadowplayで録画したファイルの音ズレについて

最近GeforceのShadowplay(Shere)で録画したファイルを編集することが多くなったのですが2時間程度の動画を編集するとき後半で音ズレが発生してしまいます。

このソフトで録画したファイルはVFRで録画されます。

premiereでも可変フレームレートを検出したとなっているのですが、前半の方は音ズレが発生せず編集できるのですが、1時間を超えたあたりから音ズレが発生してしまうようになります。

これは使用上仕方ないものなのでしょうか。

Mediaencoderでエンコードしても音ズレが発生してしまいます。

別のソフトでCFRでエンコードするほか対処はないのでしょうか？