after effect キーボードのZがYになってます。「バグ」

言語を切り替えると異常を起こすことは経験したことはあります。

キーボードを変えた経験がないので、ドイツ語のキーボードをつないだ状態で環境設定の再作成を試してください。
https://helpx.adobe.com/jp/after-effects/kb/cq02250244.html#B環境設定フォルダーの再作成

改善しない場合は、不具合を報告するサイトに投稿してください。
このフォーラムは、ユーザーフォーラムなので開発者へ意見は届きませんが、下記リンクでは開発者が見る可能性はあります。
投票を得るには、英語で質問を投稿した方がいいと思います。
https://www.adobe.com/jp/products/wishform.html

＜追記＞
ドイツ語のキーボードの配列はわからないのですが、キーボードショートカット編集の画面では、Z とY の配列が入れ替わっているのはあっているでしょうか？

バグ見つけました。

キーボードを日本語と英語とドイツ語使ってます。

ドイツ語最近マックに追加したのですが、使わなくても、after effectだとドイツのキーボードを認識しています。

他の人にも問題出てくるので、直した方がいいと思います。