Aftereffectでmp4ファイルが読み込めません

Instaの情報が多い感じでしたが下記のスレッドを参考に残

存しているファイルなどを削除してみるといかがでしょう？

(Ver3.6.2では解消されているとの記述もあるようですが、自分は使用していないためすみません)

https://community.adobe.com/t5/after-effects/the-vsni-file-is-damaged-or-unsupported/td-p/11701952

また、根本的な原因対策ではないんですが、一旦別のエンコーダーにて変換をしてみるや、

Aeでは駄目でもAdobe PleludeやMedia Encoderで直接変換できるとか試してみるのもいいかもしれません。

できればもう少し状況説明があったほうがいいでしょう。

MP4といっても内部形式にもよりますし、Aeのバージョンもかかわるためです。

コミュニティの使い方ガイドの質問に関する各スレッドも参考にしてください。
https://community.adobe.com/t5/%E3%82%B3%E3%83%9F%E3%83%A5%E3%83%8B%E3%83%86%E3%82%A3%E3%81%AE%E4%BD%BF%E3%81%84%E6%96%B9%E3%82%AC%E3%82%A4%E3%83%89/bd-p/community-help-jp?page=1&sort=latest_replies&filter=all

なお After Effects (us) から After Effectsフォーラム (jp) に移動しました。

過去のフォーラムで拡張子を *.mov に変更すると読み込めると書き込みがあります。試してみてください。