CHMファイルに出力される目次について

いつもお世話になっております。

CHMファイルに出力される目次は、基本的にTOCファイルを元に作成されると理解しているのですが、

[ブック更新]からTOC.ｆｍファイルを生成し、目次を作成した後に、

  TOC.ｆｍファイルから目次の文字列を削除してもCHMの目次として表示される章タイトル

と、

  TOC.ｆｍファイルから目次の文字列を削除したらCHMの目次として表示されないタイトル

があります。

どこかの設定によって上記違いが出るのでしょうか？

そもそも、最初の「TOCファイルを元に作成される」という理解が間違っているのでしょうか？

よろしくお願いいたします。