スクリーンとプリンタで

ayamaedaさんのおっしゃられる通り、置換されている可能性が高いと思います。
あと、FrameMakerだけでなく、他のアプリケーション（Wordなど）ではそのような現象はおきないのですか？そちらも確認してみないことには、一概にFrameMakerだけに原因があるとは言い切れないのではないでしょうか。
1年前の投稿なので、もうどうにかなってるのかも知れませんが・・・。

これはFMの問題ではなく、フォント、プリンタドライバなどの問題だと思います。
ただし、これはMacでよくある現象です。

リュウミンはLリュウミンL-KLではありませんか?
LリュウミンL-KLは細明朝体と同じポストスクリプト名を持っているので、
プリントするときに置き換えられてしまうことがあります。
インストールされているプリンタフォントを調べてみてはいかがでしょう。

しかし、さきに書いたようにMacプラットフォームで報告されているエラーなので、
Winでは正確な回避方法がわかりません。

中途半端な意見で申し訳ありませんが、
ご参考まで。

補足します。

スクリーンだとカギカッコの縦の線が短いのですが、プリンタ出力すると縦の線が上から下まで長いものになります。