Illustratorのメニューバーから項目を選ぶ際の色のハイライトが消えた

手元のマシンで確認したところ、Win11 23H2と24H2では薄いグレー、21H2では2025でも従来通りの水色のハイライトでした。
windowsのバージョンの問題でしょうか？

Windows 11の環境ですが、確かに自分のところもそうなっています。

3月12日のアップデート以後かもしれないんですが、ちょっと断言ができません。

というのも、パネルがあるものはそれ使いますし、効果以外のプルダウンをメニューで出すことが少ないこと、選択状態はわかるのであまり気にならないという点があるためです。

効果だけは古いUIのままなので、影響はしてないだけかもしれません。

フォルダ全体を再作成して改善しない場合，まだ試していなければ再インストールも行ってみてください。

https://helpx.adobe.com/jp/illustrator/kb/basic-trouble-jp.html

こちらを試してみましたか？

とくに「B. 環境設定ファイルの再作成 > フォルダ全体を再作成」を試してください。