イラストレーターでうまく写真がよみこめません

いずれもpngのようですが、それらファイルは何のソフトで作成されたものでしょうか。

もしPhotoshop以外で作成された画像であれば、まずはPhotoshopで開いて別名保存を行ってください。

jpgおよびpng双方ともあらゆるオプションを変えた状態で用意したものと差し替えを試してみましたがその様な表現にはなりませんでした。
ちなみに、他の画像に差し替えてみても同様の事が起こりますか？

あらら、とんでもない事になってますね…
とりあえずOSXだということはわかります。もう少し行った作業手順をいただけませんか？
一般的な事から考えると、配置された画像を選んだ状態で配置コマンドで置き換えにチェックを入れた状態で差し替えるファイルを選択するのだとは思いますが…
あと、ドキュメントの構造に関しても詳細がわかれば参考になるかと思います。