システムフォントが一部　四角（□□□）に表示されます

もしOSに含まれるシステムフォントを削除してしまったとする場合、他の正常な実機を参照して同じようにフォントを入れなおすか、OS自体を上書きインストールしての対処になります。

プロンプトの欄以外は表示されていますねえ。ここだけフォントがちがうのでしょうか。知らなかった…

かっこいい提案ではないのですが、Illustrator28.5を再インストールしてみてはどうでしょう。

それで必要なフォントがまた入れられると思います。