リンクを修正後の挙動について

申し訳ありません、どのようにまとめるべきが悩んでいる内に時間が経ってしまいました。
その間、本件がそれほど騒がれていないのは、「PDF互換ファイルを作成」にチェックを入れる運用をしていない方が多いからではないかと思い至りました。
私はInDesignに貼り込むパーツ作成に利用することが多いですが、Illustratorで完結し最後にPDFを書き出す案件だと「PDF互換…」は特に必要ないと思われ、
容量の増加を嫌い、基本的にチェックを入れない運用をしている者が実際に社内にもいます。
現時点では運用によって避けることになると思いますが、悩みましたが、機能リクエストは出さないことにしました。
皆さん、ありがとうございました。

みなさん、ありがとうございます。仕様であるということ了解しました。
この仕様はかなりまずいと思っているのですが、機能リクエストをざっと
眺めた限りでは関するものはなさそうでした。
運用でカバーしているので問題ないという認識なのでしょうか。

前からありますね…

閉じる→保存しますか？ の手癖と折り合いが悪く厄介です。

ドキュメント上で編集履歴がなくて上書き保存できないときは、

表示をアウトライン→プレビューと切り替えることで手早い上書き保存が可能になります。

その挙動、結構前のバージョンから同じだったりします。

それがあるので、何か編集をした場合は必ず保存を行う、ということを前提にされるのが望ましいです。