埋め込まれた画像のズレについて

illustrator cs6を使用しています。

別のデータから持ってきた画像にズレが生じていました。

そのデータがどのソフトで作られたかは不明ですが、pdfデータでした。

それをcs6のillustratorで開くと、データ内の画像はクリッピングマスクをかけられて埋め込まれていました。

それをそのままコピーペーストで新規データに持ってきたらズレが生じる画像がありました。

そういうことはよくあること何でしょうか。

どなたか教えていただけますでしょうか。

どうぞ、よろしくお願いいたします。