シーケンス書き出しの桁数指定したうえで、1からはじめたい

桁数は、ファイル名の末尾に「00」を付ければ「0000」から出力されますが、尺によっては3や5桁になることもあるのでその場合はファイル名の「0」の数を変えると調整できます。
1から開始するのは、ファイル名を書き換える方法になると思います。

＜追記＞

プロジェクトの先頭に1フレーム追加（終了時間は1フレーム後方へ）してレンダリングすれば、0000ファイルを削除するだけになると思います。

私も調べてみたのですが、連番書き出し時の命名規則の設定方法は分かりませんでした。

おっしゃる通り0からのスタートで、デュレーション（書き出される連番ファイルの枚数）に合わせて自動的に桁数が決められるようですね。

もし私が何らかの事情で連番の桁数を揃えなくてはならないとなった場合には、連番と素材名の区切り（書き出し時のファイル名末尾に#を入れるなど？）を分かりやすい記号にしたうえで通常通り連番書き出しして、フリーソフトのファイルリネームツールでうまく条件を設定して連番を振り直すといった方法で取り繕うことになるかなと思います。

的確な返信ができずスミマセン……。引き続き、何か情報をお持ちの方からご返信が寄せられることを期待しております。