プレミアプロからエンコーダーへ書き出しができない

Premiere上で書き出しするしかないですね。

私もメディアエンコーダーでキューしたら似たようにエラーになってます。

キューに送らず直接書き出すことで急場はしのげると思います。

キューを送ると一時ファイル（プロジェクトファイルの複製のようなもの）ができてそれがMedia Encoderに読み込まれる仕組みなのですが、おそらくそれがうまくいかなくなっているのだと思います。

最近Premiere Proのアップデートがあったので、もしかするとインストール時の問題でPremiere ProとMedia Encoderのバージョンが合っていないのかもしれません。

バージョンに問題がないようでしたら、急ぎの作業を終えて時間に余裕ができた際に、Premiere Proが不調な際の一般的な対処法（おかしいなと思ったら）やAdobe製品の再インストールなどをお試しいただくと良いのではないかと思います。

おかしいなと思ったら（Mac OS 版 Premiere Pro CC） 

詳細な環境説明・状況説明が無いと的確なコメントは付きにくいですよ。