自動コンピュータシャットダウン時、完了前にシャットダウンする

10～20GB程度の大きなファイルを出力する際、出力を完了させる前にシャットダウンしてしまいます。

Media Encorderの右下ステータスが、大きなファイルだと0%になっても完了しないという現象があり、どうもこの0%になったタイミングでシャットダウンのプロセスが始まり、結果出力を完了しないままシャットダウンしてエラーになって終わる、ということのようです。

回避するにはどうするといいでしょうか。