MuseにHTMLとCSSを併記しての挿入が可能ですか

Museは、InDesignの開発チームからスピンアウトしたDTPの概念を持つWebデザインアプリケーションです。

そのため、テンプレートにあたるフォーマットは「ウィジェット」と呼ぶMuse独自の仕様となっており、Wordpressなどで利用されるBootstrap等のテンプレートとは互換性がありません。

Adobe Muse でのコンポジション、メニュー、フォームウィジェットの使用

同じようなウィジェットがないか、「Adobe Muse Widget Bootstrap」などのキーワードで探してみることお勧めします。

ご申告のテンプレートのデベロッパーにMuse用に開発を依頼してみるのも一手と思います。