aftereffectsコンポジションに置き換えができません

添付していただいた画像を拝見いたしますと、After Effectsの画面内に「名称未設定プロジェクト.aep」というファイルが見つからない状態になっているようですね。

Premiere Pro上でAfter Effectsコンポジションに置き換えたクリップを、更にAfter Effectsコンポジションに置き換えて、元のAfter Effectsの「名称未設定プロジェクト.aep」を移動もしくは削除している状況が考えられるように思います。

「名称未設定プロジェクト.aep」を移動してしまっている場合には、After Effects上で再リンク（フッテージを置き換え機能で、移動先のファイルにリンクする操作）をしていただくと元に戻ると思うのですが、ここに至るまでに行われた作業の内容次第になるかと思います。