マスクのトラッキングについて

>マスクの必要部分が小さくなったり画面外にでた場合にマーカーの削除方法

キーフレームの削除ということでしたら、不要なキーフレムを選択して「delete」キーを押したり、右クリックから「消去」で消すことができます。

>横軸的な意味で必要箇所のマスクは残して途中からマスク自体を削除

横軸が時間軸という意味でしたら、マスクの不透明度のキーフレームを使って100％(マスクあり）0%（マスク無し）を切り替えることができます

（テレビ番組制作などインターレースの場合は、0%と100%を1フレで切り替えても、1フィールド50％が挟まる点に少し注意が必要かもしれません。）