私はMac OS Sierra でPremiere Pro CC2017でタイムリマップのエフェクト欄をチェックしたら時間フォルダーの中が空になっていました。

ご質問の内容は2つに分けられると思います。

まず、

>ビデオエフェクト内のタイムリマップを使用しようとしたら、FX の部分が点いてくれないので、

こちらのタイムリマップについては、FXの部分がグレーアウトしている状態で正常に機能します。

もし初めてタイムリマップをお使いになる状況でしたら、こちらのページが参考になると思います。

Adobe Premiere Pro CC でのクリップの速度とデュレーションの変更

次に、

>エフェクト欄をチェックしたら時間フォルダーの中が空になっていました。

こちらについては、エフェクトの種類別フィルターが機能している可能性が考えられます。

上記画像で赤く囲んだ部分のどれか一つでも押下されてますと、「時間」フォルダ内が空になったように表示されます。

Premiere Pro でのクリップの適用、削除、検索および分類