グリフの幅情報が一貫していないのエラーがAcrobatで修正できない

「グリフの幅情報が一貫していない」

原因がまったく別のところにあるのかもしれません。

私の経験ですが、inddのファイル名に特定の文字が含まれていて、それが原因でAcrobatのプリフライトにこのエラーが表示されてしまうことがありました。

PDF上で直そうとするよりも、そもそもの原因を見つけて解消した方が良いでしょう。

それの場合、どのフォントで起きているのかも含めて、具体的な状況の洗い出しが必要なのと同時に、

プリフライトでの修正は完全に行われるものではないので、元データまで遡る必要が出る場合があります。

今回の場合、少なくともどのフォントで起きているかの情報は必要ではないでしょうか。

可能であればどの文字で起きているかもセットであるのが望ましいところですし、

Illustrator単体データをプリフライトチェックした場合の確認もしたほうがいいかもしれません。