イラストレータでPDF X-4保存した時、カラーモードが勝手に変わる

IllustratorでPDFを開き直してしまうと、不具合が保存したときに起きたのか、PDFを無理矢理Illustratorで開き直したときに起きたのか区別がつきません。

Acrobatで開き「出力プレビュー」で「オブジェクトインスペクター」を選択してから、CMYKであるべきオブジェクトをクリックして、塗り・線等がどのカラースペースなのかを確認してみてください。

30.0でです最初期バージョンになり、どうしても多くの不具合があるままリリースされている、ということが、毎回のバージョン恒例にになってしまっています。

（人によっては最新版は絶対使わない、なんて人もいます）

アップデータは確実に当てられるのがいいとは思います。

また、PDF/XをIllustratorで開いた場合、編集情報を持たないデータを開くわけですから、開くこと自体が相当のリスクになり、どんな変化が起きるのかは誰にもわかりません。

プリフライトについてはajabonさんがおっしゃるように、Acrobat Proを用いて行うのが適切になります。

>・クレームが来たので同じファイルを同じ処理するとCMYKで保存された

ここは、最初と同様にアクションでの処理でしょうか？

とすると再現性の確立できない不具合という見方になりますかねえ。

PDF/X-4は規格上RGBオブジェクトが許容されてしまうので、作成後、どんなアプリでも過信はせず念には念で入稿前に手元でプリフライトしたほうがいいですよ。

という話につながるのですが、

先方ともども「RGBのカラーモードに誤変換された」はPDFをIllustratorで開いての確認なのでしょうか？ Acrobatでプリフライトはしていないですか？

assauseさんご指摘のバージョンの影響が考えられます。

それと，もし，「バックグラウンドで保存」「バックグラウンドで書き出し」を行っている場合は，オフでの運用をおすすめします（アップデートでいったん直っても次のアップデートで別の不具合が発生するという状況がずっと続いているので）。

（参考）

バックグラウンド保存による保存エラーについて

Illustratorが30.0とのことなのですが、現在最新の30.4ではなく、でしょうか。

（すでに30.5.1も配信されているのですが、投稿時間的には30.4が最新の状況だとは思います）

またアクションでの処理ではなく、手作業で書き出しをした場合にも再現はするでしょうか。