インデザインでepubで書き出すと画像がページをまたいでしまいます。

yusuke_sさんが書かれている通りだと思います。

InDesignから書き出したepubは、自分だけの趣味なら良いのですけど、仕事として成果物にするには中身をいじる必要がでてくるでしょう。それには、HTMLやCSSの知識はもちろんのこと、epub自体の知識も必要になります。

epub自体の知識を得るには、個人的には「電書協EPUB 3制作ガイド」に同梱されているPDFがベストだと考えています。これは一見とても分かりにくそうなのですが、きちんと読み解くと、これ以上はないというくらい良くまとまっています。ぜひ参考にしてください。

電書協 EPUB 3 制作ガイド

なお、私はInDesignから書き出したepubをいじるのは煩雑すぎるので、XMLを書き出して、それを自作のツールでepubに変換しています。人によって方法は異なると思いますが、epub書き出し機能を利用しない方法も視野に入れるとよいでしょう。