ブック内でテキストの検索・置換をする

端的に回答すると、ありません…残念なんですが。bizarre_nさんの案でいけますが、重たさに耐えられればの話ですねー。半分ずつとかでも。

正規表現でなくてよければ、いったんブック全体をPDF書き出しして、Acrobat上で検索、ノンブルを参照して当該inddを処理、などの手順になるかと思います。

重たくなる件、
300ページと聞くと嗚咽ですが、文庫サイズていどであれば環境設定＞表示画質 で文字のグリーキングの限界値を上げるなどで、改善とまではいきませんが緩和はできるかもしれません。

あとはストーリーが長大になるとインライン入力はストレスの塊でしかないので、環境設定＞高度なテキスト＞ラテン文字以外にインライン入力を適用 をオフにするとか。

macOSの場合ですが、インライン入力をオフにするとIMウィンドウの位置が固定で、しかもありがたくない位置に出てとても使えないので、別ウィンドウで入力を済ませてからストーリー内に反映するスクリプトを作ったことがあります。ニーズに合うなら試してみてください。

https://ajabon.catfood.jp/?p=2715

ブックにしているドキュメントを全部開いて、検索対象を「すべてのドキュメント」にします。

これは開いているドキュメントすべてを検索対象にする選択肢ですから、ご希望のことができるでしょう。