Indesignでソートで印刷ができないのですが

「ソート」というのは、InDesignの「丁合い」のことでしょうか？

そして「一枚一枚印刷してしまう」というのは、「ページ順に印刷されず、ページごとに印刷される」ということでしょうか？

もし、上記のような状況であれば、取り急ぎPDFに書き出して、Acrobatから印刷を行なってみて下さい。

また、プリントの設定はプリンタ側で設定されず、InDesignもしくはAcrbatのプリントダイアログ上で設定を行なって下さい。