InDesignCC2017で作成＆保存したのに、そのファイルをクリックして開くとCS6が立ち上がってしまう

inddファイルをダブルクリックした時に、どのバージョンのInDesignで開かれるかは、InDesignではなくOS側の問題です。なので、MacなのかWindowsなのかをバージョンも含めて明記してください。それぞれで対処方法が異なります。

OS環境が不明ですが、ダブルクリックでしたら拡張子とアプリケーションの関連付けの問題になりますから、

OS側の設定（エクスプローラーやFinder）を確認してみてください。