PDF書き出しの出力ページの指定

スクリプトで解決するのが手っ取り早いかと思います。

app.pdfExportPreferences.pageRange = "0";

このスクリプトを実行すると、ページ範囲指定の中に「0」をセットするのですが、

普通、ドキュメントのノンブルに「0」は指定しないので 、結果的にリセットできます。

PDF書き出し前に実行するか、

手動では忘れてしまいそうならイベントリスナーにしてStartupScriptに登録してしまえば自動制御もできます。

自動制御したい場合は、下記のスクリプトを適当な名前で保存して、

//@targetengine "PDFpageRangeReset"

app.addEventListener("afterOpen", myFunc, false);
function myFunc(e) {
    app.pdfExportPreferences.pageRange = "0";
}

InDesign 2021（v16）であれば下記の場所に移動します。

・Macの場合

~/Library/Preferences/Adobe InDesign/Version 16.0-J/ja_JP/Scripts/startup scripts

・Windowsの場合

~\AppData\Roaming\Adobe\InDesign\Version 16.0-J\ja_JP\Scripts\startup scripts

この場所に「startup scripts」というフォルダがなければ作成してください。

これで、InDesignが起動するたびにこのスクリプトを読み込み、ファイルを開いたら自動で実行する仕組みができあがります。