Doppelt Markiert??

Für eine Hausarbeit habe ich bei wichtigen Stellen einer PDF Datei Kommentare hinzugefügt. Diese behinhalten Kapitelnummern, wie etwa 2.1. oder 3.3., damit ich diese bei der Kommentar-Suchfunktion leichter finde. Jedoch ist das Problem, dass wenn ich bei der Suchfunktion zB. alle Kommentare mit 2.1. suche, all die Markierungen, die ich davor gemacht habe weg sind. Das heißt es ist alles komplett leer. Markier ich mir dann die jeweilige Stelle erneut, damit es für mich überschaubarer er ist, und die Kommentar Suchfunktion schließe, ist die Stelle doppelt markiert. 
Was bitte kann ich tun, damit ich die markierten Stellen auch dann sehe, wenn ich nach Kommentaren suche??