wordからAdobe Acrobat Pro DCでPDF書き出し

wordで作られた縦書き二段組の文書を、wordのAcrobatタブにあるPDF書き出しからPDF書き出しをしたのですが、文字の編集領域（テキストの境界ボックス？）がずれてしまいます。

別名保存→PDFで書き出しをするとこのずれは起こらないのですが、印刷所に入稿するデータ形式として「PDF/x-1a:2001」に設定する必要があり、Acrobatタブからの書き出しが推奨されています。

この領域のずれを解消するにはどうしたらよいでしょうか？

または、この境界ボックスが印刷に際してなんの影響もないのであれば、このまま利用しますが、影響はありますか？

アドバイス頂けますと幸いです。